Uma obturação insatisfatória feita com guta-percha pode ser facilmente removida rotacionando uma, duas ou se possível até três pequenas limas Hedström ao redor da obturação e tracionando-a. Caso esta manobra não seja bem-sucedida, pode-se dissolver a guta-percha com um instrumento aquecido, clorofórmio, xilol ou óleo de laranja, juntamente com a ação mecânica de instrumentos manuais. Instrumentos rotatórios, como brocas de Gates-Glidden, podem ser usados na parte reta do canal. Estas brocas estão disponíveis em uma variedade de tamanhos e apresentam uma ponta romba que reduz o risco de perfurações. Muito cuidado deve ser tomado quando estas brocas são utilizadas, já que geram bastante calor e podem danificar as estruturas periodontais. Isto pode ser minimizado pelo uso intermitente das mesmas.